93年，更名為南京醫科大學。臨床醫學（八年制）、臨床醫學（5 3一體化）和口腔醫學（五年制）三個專業其中外科學為國家重點學科，醫學院臨床醫學學科進入全球排名前1%，是南京大學11個進入全球前1%的學科之一，當年南京醫科大學希望和南京大學合并，可是南京大學看不上，尤其南京大學學生受不了當年分數比他們低一百多分的學生拿南京大學畢業證，就和南京醫科大學罵戰，后來南京大學想合并了，南京醫科大學校方又反悔了。
星星高校專業那些事為您分析、分享、解惑南京大學是著名的世界一流建設大學，教育部直屬的211/985重點建設大學。國家首批211重點建設大學，首批985建設大學，著名的c9之一，綜合實力處于國內前列，但是他的臨床醫學怎么樣？這要從過去和現在兩方面分析，過去的時候，南京大學的醫學院是國內一流，現在嘛，就比較一般了。
歷史上的南京大學的臨床醫學那絕對是國內第一，為何這樣說，咱沖南京大學的歷史開始講起，。南京大學在歷史上是著名的國立中央大學，那實力國內第一，亞洲第一，世界零先，看經費。經費是第二名的一倍多，實力比當時的西南聯合大學（清華大學 北京大學 南開大學）都厲害，當時醫學水平也是國內頂級，為何這為何這樣說，因為當時的南京大學醫學院是中央大學醫學院，實力國內第一，創立時名為國立第四中山大學醫學院，當時南京大學叫第四國立中山大學（第一中山大學是中山大學，第二中山大學是浙江大學，第三中山大學是武漢大學，第四中山大學是南京大學，第五中山大學是河南大學）南京大學醫學院中國創辦的第一所國立大學醫學院。
1928年5月更名為國立中央大學醫學院，1932年獨立為國立上海醫學院，為當時中國唯一的國立醫學院，后來陸續建立了了六大國立醫學院，上海醫學院也是6大國立醫學院之首。抗戰爆發后，學院內遷輾轉遷至四川重慶，抗戰勝利，學院遷回上海，于1952年更名為上海第一醫學院。1985年，上海第一醫學院定名為上海醫科大學，后并入復旦大學，成為復旦大學上海醫學院原校址由上海醫學院援建師資，成立了重慶醫科大學，
《國立上海醫學院抗戰時期舊址校門復建記》石碑矗立在重慶醫科大學的《國立上海醫學院抗戰時期舊址校門復建記》石碑上銘刻：“公元一九五六年，上醫響應國家號召，再度西進，溯江而上，傾半校之力，始創重慶醫學院。上醫重醫，血脈相連，”也就是說當年中央大學醫學院實力，是現在的復旦大學醫學院 重慶醫科大學。你說牛不牛，國立第一醫學院絕對牛那現在南京大學醫學院水平呢1987年經教育部（原國家教委）批準重建，成為教育部（原國家教委）第一所直屬綜合性大學長學制醫學院（當時那幾個厲害的醫學院（上海醫學院，中山醫學院，協和醫學院，同濟醫學院，華西醫學院，湘雅醫學院都是衛生部直屬的，上海二醫是上海市直屬，首都醫科大學是北京是高校，教育部沒有厲害的醫科院校）基礎醫學一級學科博士點、臨床醫學一級學科博士點和博士后流動站，口腔醫學一級學科碩士點，護理學專業學位碩士點；本科專業：臨床醫學（八年制）、臨床醫學（5 3一體化）和口腔醫學（五年制）三個專業其中外科學為國家重點學科，醫學院臨床醫學學科進入全球排名前1%，是南京大學11個進入全球前1%的學科之一，
南京大學醫學院附屬鼓樓醫院，南京大學醫學院附屬金陵醫院（解放軍南京總醫院）南京大學醫學院附屬口腔醫院，南京大學醫學院附屬仙林鼓樓醫院（南京市仙林鼓樓醫院）強不強看不出來，咱看教育部學科評估吧。很遺憾，，南京大學醫學院2017，所有醫學學科全部不參評。南京大學這個辦法好，讓大家摸不透自己的水平，但是南京大學2012年第三次學科評估參加了，咱看第三次。
2012年學科評估，看南京大學還是不錯的，但是現在塊10年過去了。不知道怎么了，國家重點臨床專科排行國家重點臨床專科數量，南京大學醫學院有10個美全國排名28名，而南京醫科大學有28個全國排名16名，，顯然比較落后。具體分布，南京大學醫學院附屬鼓樓醫院8個，南京大學醫學院附屬口腔醫學院2個，國家醫療數據中心排行19個臨床專業，南京大學沒有一個學科進入前15名，南京醫科大學只有1個進入前15名。
