菌種鑒定的方法一般有常規鑒定和分子生物學方法：（1）常規鑒定：菌落形態觀察、革蘭氏染色、菌毛染色、糖類分解實驗、吲哚實驗、淀粉水解實驗、V-P實驗、甲基紅實驗、檸檬酸鹽利用實驗、硝酸鹽還原實驗、接觸酶實驗等（2）分子生物學方法：細菌16SrDNA菌種鑒定：提取DNA，特定引物PCR擴增，PCR產物純化測序，進化樹分析；真菌18SrDNA/ITS菌種鑒定流程也是一樣的菌種種類有那些,二、液體菌種母種→搖瓶菌種→發酵罐菌種1、母種液體菌種的母種和固體菌種的母種制作工藝相同2、搖瓶菌種搖瓶菌種：是指用三角瓶做容器，接種后在搖床上培養的菌種，搖床分為旋轉式搖床和往復式搖床,3、發酵罐菌種發酵罐菌種：是指用專用的食用菌液體菌種發酵罐培養的液體菌種。
二、液體菌種母種→搖瓶菌種→發酵罐菌種1、母種液體菌種的母種和固體菌種的母種制作工藝相同2、搖瓶菌種搖瓶菌種：是指用三角瓶做容器，接種后在搖床上培養的菌種，搖床分為旋轉式搖床和往復式搖床。三角瓶有直口和斜口兩種，我們通常使用直口三角瓶。搖瓶菌種的培養時間是5-10天。3、發酵罐菌種發酵罐菌種：是指用專用的食用菌液體菌種發酵罐培養的液體菌種。發酵罐菌種的培養時間是5-10天
首先你要確定待鑒定的菌種一定是純種。如果菌種不純，所觀察到的現象則是混合現象，這樣自然不會得到正確的結果。因此在鑒定之前，首先要將菌種純化。純化方法，一般有2種：平板劃線單菌落分離法和單細胞分離法。前一種操作簡便，效果良好，適用范圍廣。菌種鑒定的方法一般有常規鑒定和分子生物學方法：（1）常規鑒定：菌落形態觀察、革蘭氏染色、菌毛染色、糖類分解實驗、吲哚實驗、淀粉水解實驗、V-P實驗、甲基紅實驗、檸檬酸鹽利用實驗、硝酸鹽還原實驗、接觸酶實驗等（2）分子生物學方法：細菌16SrDNA菌種鑒定：提取DNA，特定引物PCR擴增，PCR產物純化測序，進化樹分析；真菌18SrDNA/ITS菌種鑒定流程也是一樣的
{2。
